Po procházení Googlem a hraní s konfigurací bylo řešení mnohem jednodušší:
- V aplikaci MagicaVoxel přejděte stisknutím klávesy Tab do režimu Svět.
- Stiskněte Přesunout > Ground pro přesunutí modelu na zem.
- Ukládejte a exportujte a vše je opět seřazeno :)